Mgr. Igor Koloniuk, Ph.D.

Funkce: Vedoucí oddělení - Rostlinná virologie

Kontaktní údaje

Telefon: 420387775531; 420387775521
E-mail: koloniuk@umbr.cas.cz
Místnost: 202, 220

Popis

Postdokorand otevřel novou výzkumnou problematiku - výzkum mykovirů ve fytopatogenních a entomopatogenních houbách, na kterém nyní pracují tři vědečtí pracovníci a jeden doktorand. Byly testovány desítky vzorků hub na přítomnost RNA virů, v úzké spolupráci s University of Kentucky byl v patogenní houbě Phomopsis longicolla identifikován nový virus a byla zjištěna jeho genomová sekvence. Dále je chystána detailní analýza vlivu tohoto viru na transkriptom hostitele. 

Publikace
Celkem nalezeno: 30 záznamů
Fránová J., Koloniuk I., Lenz O., Sakalieva D. (2018) Molecular diversity of “Candidatus Phytoplasma mali” strains associated with apple proliferation disease in Bulgarian germplasm collection Folia Microbiologica on-line first : DOI: 10.1007/s12223-018-0660-x
Fránová J., Lenz O., Přibylová J., Špak J., Koloniuk I., Suchá J., Paprštein F. (2018) “Candidatus Phytoplasma asteris” and “Candidatus Phytoplasma mali” strains infecting sweet and sour cherry in the Czech Republic Journal of Phytopathology 166 : 59-66.
DOI: 10.1111/jph.12661
Koloniuk I., Fránová J. (2018) Complete nucleotide sequence and genome organization of red clover associated virus 1 (RCaV1), a putative member of the genus Waikavirus (family Secoviridae, order Picornavirales) Archives of Virology 163 (12) : 3447–3449.
DOI: 10.1007/s00705-018-4005-5
Koloniuk I., Fránová J., Sarkisová T., Přibylová J. (2018) Complete genome sequences of two divergent isolates of strawberry crinkle virus coinfecting a single strawberry plant Archives of Virology 163 (9) : 2539–2542.
DOI: 10.1007/s00705-018-3860-4
Koloniuk I., Fránová J., Sarkisová T., Přibylová J., Lenz O., Petrzik K., Špak J. (2018) Identification and molecular characterization of a novel varicosa-like virus from red clover Archives of Virology 163 (8) : 2213–2218.
DOI: 10.1007/s00705-018-3838-2
Koloniuk I., Přibylová J., Fránová J. (2018) Molecular characterization and complete genome of a novel nepovirus from red clover Archives of Virology 163 : 1387–1389.
DOI: 10.1007/s00705-018-3742-9
Koloniuk I., Sarkisová T., Petrzik K., Lenz O., Přibylová J., Fránová J., Špak J., Lotos L., Beta Ch., Katsiani A., Candresse T., Maliogka V.I. (2018) Variability Studies of Two Prunus-Infecting Fabaviruses with the Aid of High-Throughput Sequencing Viruses 10 (4) : 204.
DOI: 10.3390/v10040204
Koloniuk I., Thekke-Veetil T., Reynard J.S., Pleško I.M., Přibylová J., Brodard J., Kellenberger I., Sarkisová T., Špak J., Lamovšek J., Massart S., Ho T., Postman J.D., Tzanetakis I.E. (2018) Molecular Characterization of Divergent Closterovirus Isolates Infecting Ribes Species Viruses 10 (7) : 369.
DOI: 10.3390/v10070369
Lenz O., Sarkisová T., Koloniuk I., Fránová J., Přibylová J., Špak J. (2018) Red clover-associated luteovirus – a newly classifiable member of the genus Luteovirus with an enamo-like P5 protein Archives of Virology 163 (12) : 3439–3442.
DOI: 10.1007/s00705-018-3997-1
Massart S., Chiumenti M., de Jonghe Ch., Glover R., Haegeman A., Koloniuk I., Komínek P., Kreuze J., Kutnjak D., Lotos L., Maclot F., Maliogka V.I., Maree H., Olivier T., Olmos A., Pooggin M., Reynard J.S., Ruiz-García A.B., Šafářová D., Schneeberger P.H.H., Sela N., Turco S., Vainio E.J., Varallyai E., Verdin E., Westenberg M., Brostaux Y., Candresse T. (2018) Virus detection by high-throughput sequencing of small RNAs: large scale performance testing of sequence analysis strategies Phytopathology accepted : DOI: 10.1094/PHYTO-02-18-0067-R
Suzuki N., Ghabrial S., Kim K.H., Pearson M., Marzano S.Y.L., Yaegashi H., Xie J., Guo L., Kondo H., Koloniuk I., Hillman B.I. (2018) ICTV Virus Taxonomy Profile: Hypoviridae Journal of general virology 99 : 615-616.
DOI: 10.1099/jgv.0.001055
Hrabáková L., Grum-Grzymailo Alexey, Koloniuk I., Debets Alfons, Sarkisová T., Petrzik K. (2017) The alkalophilic fungus Sodiomyces alkalinus hosts beta- and gammapartitiviruses together with a new fusarivirus PLoS ONE 12 (11) : e0187799.
DOI: 10.1371/journal.pone.0187799
Hrabáková L., Koloniuk I., Petrzik K. (2017) Phomopsis longicolla RNA virus 1 - Novel virus at the edge of myco- and plant viruses Virology 506 : 14-18.
DOI: 10.1016/j.virol.2017.03.003
Lenz O., Přibylová J., Fránová J., Koloniuk I., Špak J. (2017) Identification and characterization of a new member of the genus Luteovirus from cherry Archives of Virology 162 (2) : 587–590.
DOI: 10.1007/s00705-016-3125-z
Špak J., Přibylová J., Šafářová D., Lenz O., Koloniuk I., Navrátil M., Fránová J., Špaková V., Paprštein F. (2017) Cherry necrotic rusty mottle and Cherry green ring mottle viruses in Czech cherry germplasm Plant protection science 53 (4) : 195-200.
DOI: 10.17221/160/2016-PPS
Fránová J., de Sousa E., Koloniuk I., Mimoso C., Matos J., Cardoso F., Contaldo N., Paltrinieri S., Bertaccini A. (2016) Multigene characterization of a new ‘Candidatus Phytoplasma rubi’-related strain associated with blackberry witches’ broom International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 66 : 1438-1446.
DOI: 10.1099/ijsem.0.000871
Fránová J., Přibylová J., Koloniuk I., Podrábská K., Špak J. (2016) Multigene Sequence Analysis of Aster Yellows Phytoplasma Associated with Primrose Yellows Journal of Phytopathology 164 : 166-176.
DOI: 10.1111/jph.12442
Petrzik K., Koloniuk I., Přibylová J., Špak J. (2016) Complete genome sequence of a currant latent virus (Cheravirus, Secoviridae) Archives of Virology 161 : 491-493 .
DOI: 10.1007/s00705-015-2679-5
Petrzik K., Koloniuk I., Sarkisová T., Číhal L. (2016) Detection of herbaceous-plant pararetrovirus in lichen herbarium samples Acta Virologica 60 (2) : 196-200.
DOI: 10.4149/av_2016_02_196
Petrzik K., Koloniuk I., Sarkisová T., Hrabáková L. (2016) Detection and genome sequence of a new betapartitivirus joined with Cucurbitaria piceae Borthw. fungus causing bud blight of spruce in the Czech Republic Archives of Virology 161 (5) : 1405-1409.
DOI: 10.1007/s00705-015-2692-8

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Ústav molekulární biologie rostlin
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA