Mgr. Igor Koloniuk, Ph.D.

Funkce: Vedoucí oddělení - Rostlinná virologie

Kontaktní údaje

Telefon: 420387775531; 420387775521
E-mail: koloniuk@umbr.cas.cz
Místnost: 202, 220

Popis

Postdokorand otevřel novou výzkumnou problematiku - výzkum mykovirů ve fytopatogenních a entomopatogenních houbách, na kterém nyní pracují tři vědečtí pracovníci a jeden doktorand. Byly testovány desítky vzorků hub na přítomnost RNA virů, v úzké spolupráci s University of Kentucky byl v patogenní houbě Phomopsis longicolla identifikován nový virus a byla zjištěna jeho genomová sekvence. Dále je chystána detailní analýza vlivu tohoto viru na transkriptom hostitele. 

Publikace
Celkem nalezeno: 36 záznamů
Fránová J., Koloniuk I., Lenz O., Sakalieva D. (2019) Molecular diversity of “Candidatus Phytoplasma mali” strains associated with apple proliferation disease in Bulgarian germplasm collection Folia Microbiologica 64 : 373-382.
DOI: 10.1007/s12223-018-0660-x
Fránová J., Přibylová J., Koloniuk I. (2019) Molecular and Biological Characterization of a New Strawberry Cytorhabdovirus Viruses 11 : 982.
DOI: 10.3390/v11110982
Fránová J., Sarkisová T., Jakešová H., Koloniuk I. (2019) Molecular and biological properties of two putative new cytorhabdoviruses infecting Trifolium pratense Plant Pathology 68 : 1276–1286.
DOI: 10.1111/ppa.13065
Koloniuk I., Přibylová J., Fránová J., Špak J. (2019) Genomic characterization of Malus domestica virus A (MdoVA), a novel velarivirus infecting apple Archives of Virology on-line first : DOI: 10.1007/s00705-019-04478-5
Massart S., Chiumenti M., de Jonghe Ch., Glover R., Haegeman A., Koloniuk I., Komínek P., Kreuze J., Kutnjak D., Lotos L., Maclot F., Maliogka V.I., Maree H., Olivier T., Olmos A., Pooggin M., Reynard J.S., Ruiz-García A.B., Šafářová D., Schneeberger P.H.H., Sela N., Turco S., Vainio E.J., Varallyai E., Verdin E., Westenberg M., Brostaux Y., Candresse T. (2019) Virus detection by high-throughput sequencing of small RNAs: large scale performance testing of sequence analysis strategies Phytopathology accepted : DOI: 10.1094/PHYTO-02-18-0067-R
Petrzik K., Koloniuk I., Sehadová H., Sarkisová T. (2019) Chrysoviruses inhabited symbiotic fungi of lichens. Viruses 11 : 1120.
DOI: 10.3390/v11121120
Vinokurov K., Koloniuk I. (2019) Discovery and characterization of a novel alphavirus-like RNA virus from the red firebug Pyrrhocoris apterus L. (Heteroptera). Journal of Invertebrate Pathology 166 : article number 107213.
DOI: 10.1016/j.jip.2019.107213
Vinokurov K., Koloniuk I. (2019) A novel alphavirus-like superfamily related virus of the red firebug Pyrrhocoris apterus, PaV1 demonstrates a wide set of tools affecting host immunity. In: Abstracts from 8th International Symposium on Molecular Insect Science, 7-10 July, 2019, Sitges, nr. Barcelona, Spain.
Fránová J., Lenz O., Přibylová J., Špak J., Koloniuk I., Suchá J., Paprštein F. (2018) “Candidatus Phytoplasma asteris” and “Candidatus Phytoplasma mali” strains infecting sweet and sour cherry in the Czech Republic Journal of Phytopathology 166 : 59-66.
DOI: 10.1111/jph.12661
Koloniuk I., Fránová J. (2018) Complete nucleotide sequence and genome organization of red clover associated virus 1 (RCaV1), a putative member of the genus Waikavirus (family Secoviridae, order Picornavirales) Archives of Virology 163 (12) : 3447–3449.
DOI: 10.1007/s00705-018-4005-5
Koloniuk I., Fránová J., Sarkisová T., Přibylová J. (2018) Complete genome sequences of two divergent isolates of strawberry crinkle virus coinfecting a single strawberry plant Archives of Virology 163 (9) : 2539–2542.
DOI: 10.1007/s00705-018-3860-4
Koloniuk I., Fránová J., Sarkisová T., Přibylová J., Lenz O., Petrzik K., Špak J. (2018) Identification and molecular characterization of a novel varicosa-like virus from red clover Archives of Virology 163 (8) : 2213–2218.
DOI: 10.1007/s00705-018-3838-2
Koloniuk I., Přibylová J., Fránová J. (2018) Molecular characterization and complete genome of a novel nepovirus from red clover Archives of Virology 163 : 1387–1389.
DOI: 10.1007/s00705-018-3742-9
Koloniuk I., Sarkisová T., Petrzik K., Lenz O., Přibylová J., Fránová J., Špak J., Lotos L., Beta Ch., Katsiani A., Candresse T., Maliogka V.I. (2018) Variability Studies of Two Prunus-Infecting Fabaviruses with the Aid of High-Throughput Sequencing Viruses 10 (4) : 204.
DOI: 10.3390/v10040204
Koloniuk I., Thekke-Veetil T., Reynard J.S., Pleško I.M., Přibylová J., Brodard J., Kellenberger I., Sarkisová T., Špak J., Lamovšek J., Massart S., Ho T., Postman J.D., Tzanetakis I.E. (2018) Molecular Characterization of Divergent Closterovirus Isolates Infecting Ribes Species Viruses 10 (7) : 369.
DOI: 10.3390/v10070369
Lenz O., Sarkisová T., Koloniuk I., Fránová J., Přibylová J., Špak J. (2018) Red clover-associated luteovirus – a newly classifiable member of the genus Luteovirus with an enamo-like P5 protein Archives of Virology 163 (12) : 3439–3442.
DOI: 10.1007/s00705-018-3997-1
Suzuki N., Ghabrial S., Kim K.H., Pearson M., Marzano S.Y.L., Yaegashi H., Xie J., Guo L., Kondo H., Koloniuk I., Hillman B.I. (2018) ICTV Virus Taxonomy Profile: Hypoviridae Journal of general virology 99 : 615-616.
DOI: 10.1099/jgv.0.001055
Hrabáková L., Grum-Grzymailo Alexey, Koloniuk I., Debets Alfons, Sarkisová T., Petrzik K. (2017) The alkalophilic fungus Sodiomyces alkalinus hosts beta- and gammapartitiviruses together with a new fusarivirus PLoS ONE 12 (11) : e0187799.
DOI: 10.1371/journal.pone.0187799
Hrabáková L., Koloniuk I., Petrzik K. (2017) Phomopsis longicolla RNA virus 1 - Novel virus at the edge of myco- and plant viruses Virology 506 : 14-18.
DOI: 10.1016/j.virol.2017.03.003
Lenz O., Přibylová J., Fránová J., Koloniuk I., Špak J. (2017) Identification and characterization of a new member of the genus Luteovirus from cherry Archives of Virology 162 (2) : 587–590.
DOI: 10.1007/s00705-016-3125-z

Více publikací

KONTAKT

Biologické centrum AV ČR, v.v.i.
Ústav molekulární biologie rostlin
Branišovská 1160/31
370 05 České Budějovice

NAJÍT PRACOVNÍKA