Virologové získali nový projekt

Dr. Igoru Koloniukovi ve spolupráci s dalšími vědeckými pracovníky oddělení virologie Ústavu molekulární biologie rostlin BC se podařilo získat v soutěži nový projekt COST 2015-2017 "Jak využívat a interpretovat přebytek dat z paralelního sekvenování v rostlinnévirologii?"

Projekt je zaměřen na aplikaci nové generace sekvenování (NGS) v rostlinné virologii. Technologie NGS je vhodná nejen pro determinaci virů, které se vyskytují ve zkoumaném vzorku ve vysoké koncentraci, ale zejména pro odhalení přítomnosti virů v tzv. latentní fázi (bez zjevných příznaků virové infekce), virů vyskytujících se ve velmi nízké koncentraci a dosud nepopsaných nových virů.  NGS umožňuje detekci a identifikaci rostlinných patogenů bez předchozí znalosti jejich genetických vlastností.

Budeme se zabývat otázkami souvisejícími s interpretací dat a následným odhalením falešně negativních či pozitivních výsledků. Rostliny jetele a chmele budou použity jako modelové objekty. Očekávané výsledky projektu by měly přispět k praktickému uplatnění NGS v oblasti patologie rostlin.